صدمه به مغز و نخاع توسط بیماری ام اس ممکن است روی عملکرد اعضاء بدن اثر بگذارد.
به طور مثال اگر اعصاب بینائی دچار آسیب شود باعث تاری دید، دوبینی و درد چشم می شود.
همچنین اگر مخچه آسیب ببیند شخص دچار عدم تعادل شده و راه رفتن برای وی مشکل می شود.
در صورتی که اعصاب دستور دهنده به سیستم ادراری آسیب ببیند باعث از دست رفتن کنترل ادرار یا احتباس آن در فرد می شود.
ولی اگر آسیب در قسمت حسی اعصاب نخاعی به وجود آید، باعث کرختی یا احساس سوزن سوزن شدن می شود.
و در آخر اگر این آسیب در اعصاب حرکتی ایجاد شود باعث ضعف و فلج عضلات و اندام ها می شود.